Supply Chain ได้รับผลกระทบจากอีคอมเมิร์ซโดยตรง
ความชื่นชอบต่อกระแสทางกายภาพช่วยเพิ่มระดับการเคลื่อนย้ายสินค้าและสินค้าคงคลังสำหรับ บริษัท ต่างๆ สำหรับกระแสข้อมูลอีคอมเมิร์ซได้ปรับความสามารถในการประมวลผลข้อมูลให้เหมาะสมกว่าที่ บริษัท เคยมีและสำหรับกระแสการเงินอีคอมเมิร์ซช่วยให้ บริษัท ต่างๆมีโซลูชันการชำระเงินและการชำระเงินที่มีประสิทธิภาพมากขึ้น
นอกจากนี้อีคอมเมิร์ซยังมีผลกระทบต่อSupply Chainในระดับที่ซับซ้อนมากขึ้นประการแรกช่องว่างด้านประสิทธิภาพจะถูกกำจัดออกไปเนื่องจาก บริษัท ต่างๆสามารถระบุช่องว่างระหว่างSupply Chainระดับต่างๆได้ด้วยวิธีการแก้ปัญหาทางอิเล็กทรอนิกส์
ผลจากการเกิดขึ้นของอีคอมเมิร์ซความสามารถใหม่ ๆ เช่นการใช้ระบบ ERP เช่น SAP ERP ได้ช่วยบริษัท ต่างๆในการจัดการการดำเนินงานกับลูกค้าและซัพพลายเออร์ ถึงกระนั้นความสามารถใหม่เหล่านี้ก็ยังไม่ถูกใช้อย่างเต็มที่
บริษัทเทคโนโลยีจะยังคงลงทุนกับโซลูชันซอฟต์แวร์อีคอมเมิร์ซใหม่ ๆ ต่อไปเนื่องจากพวกเขาคาดหวังผลตอบแทนจากการลงทุน ประการที่สี่อีคอมเมิร์ซจะช่วยแก้ปัญหาหลาย ๆ ด้านที่ บริษัท อาจรู้สึกยากที่จะรับมือเช่นอุปสรรคทางการเมืองหรือการเปลี่ยนแปลงข้ามประเทศ สุดท้ายอีคอมเมิร์ซช่วยให้ บริษัท ต่างๆมีวิธีที่มีประสิทธิภาพและประสิทธิผลมากขึ้นในการทำงานร่วมกันภายในSupply Chain
อย่างไรก็ตามอีคอมเมิร์ซขาดการโต้ตอบกับลูกค้าโดยเฉพาะอย่างยิ่งผู้ที่ชอบการเชื่อมต่อแบบตัวต่อตัว ลูกค้ายังกังวลกับความปลอดภัยของธุรกรรมออนไลน์และมักจะยังคงภักดีต่อผู้ค้าปลีกที่มีชื่อเสียงในช่วงไม่กี่ปีที่ผ่านมาร้านค้าปลีกเสื้อผ้าเช่น Tommy Hilfiger ได้เริ่มเพิ่มแพลตฟอร์ม Virtual Fit ให้กับเว็บไซต์อีคอมเมิร์ซเพื่อลดความเสี่ยงที่ลูกค้าจะซื้อเสื้อผ้าผิดขนาดแม้ว่าสิ่งเหล่านี้จะแตกต่างกันไปมากตามวัตถุประสงค์ก็ตาม